Kaiken toiminnan, johon Pohjoismaiden ministerineuvosto osallistuu, tulee olla sopusoinnussa ministerineuvoston ja yksittäisten Pohjoismaiden yleisten strategioiden kanssa. Arktinen yhteistyöohjelma täydentää Pohjoismaiden ministerineuvoston muita ohjelmia, strategioita ja toimintasuunnitelmia, joihin voi vastaavasti sisältyä ajankohtaisia arktisia kysymyksiä.
Tämä yhteistyöohjelma tarjoaa pohjan yhteistyölle, jota Pohjoismaiden ministerineuvosto tekee vuosina 2009–2011 Arktisen neuvoston maiden kanssa arktisista kysymyksistä, EU:n kanssa muun muassa pohjoisen ulottuvuuden arktisen ikkunan kehittämisestä sekä Pohjoismaiden arktisten naapureiden kanssa.
Seuraavien yleistavoitteiden tulee antaa suuntaa Pohjoismaiden ministerineuvoston arktisia alueita koskevan yhteistyötoiminnan suunnittelulle ja toteutukselle:
Politiikan alalla kyse on etenkin siitä, että jatketaan järkevien yhteistyömuotojen ja -foorumeiden kehittämistä arktisten valtioiden välille. Tavoitteena on, että maat pystyisivät vastavuoroisesti ja yhteisvoimin kantamaan vastuun sellaisten yhteishankkeiden toteuttamisesta, jotka ovat edellytyksenä yhteistyön yleistavoitteiden täyttymiselle.
Aloitteista ja toiminnasta vastaavat yleensä Pohjoismaat Arktisen neuvoston puitteissa. Kysymykseen voivat kuitenkin tulla myös muut aloitteet, mikäli Arktisen neuvoston ei katsota olevan oikea foorumi.
Mainittujen yleistavoitteiden puitteissa keskitytään vuosina 2009–2011 seuraaviin painopistealueisiin:
Tämä arktinen yhteistyöohjelma koskee koko ministerineuvoston työtä arktisten kysymysten parissa. Eri alojen ministerineuvostot voivat syventää ohjelmassa mainittuja painopistealueita omissa yhteistyöohjelmissaan sisällyttäen niihin esimerkiksi seuraavaa:
Arktiseen yhteistyöohjelmaan sisältyvät konkreettiset panostukset toteutetaan osin yksittäisinä hankkeina maiden ja Pohjoismaissa tai lähialueilla toimivien järjestöjen ja laitosten hakemusten pohjalta, osin aloitteina, jotka pohjautuvat eri alojen ministerineuvostojen tarpeisiin tukea ajankohtaisia poliittisia prosesseja.
Pohjoismaiden ministerineuvoston Arktiksella tapahtuva toiminta rahoitetaan osin asianomaisten ministerineuvostojen varoin, osin yhteistyöministereiden (MR-SAM) alaisista erityismäärärahoista ja mahdollisesti yhteisrahoituksella. Ministerineuvoston erityismäärärahat on kohdennettu tämän yhteistyöohjelman täytäntöönpanoon.
Ministerineuvosto voi osallistua Arktisen neuvoston pysyvien työryhmien ja yhteistyöinstrumenttien rahoitukseen. Myös ministerineuvoston muissa stipendi- ja liikkuvuusohjelmissa voidaan tukea Arktiksella tapahtuvaa toimintaa.
Ministerineuvosto tiedottaa ohjelmasta muun muassa verkkosivustonsa kautta. Yhteydenpidossa hyödynnetään nykyisiä pohjoismaisia laitoksia.
Muun muassa matkakustannusten, konsulttipalveluiden ja palkkaehtojen osalta tulee noudattaa projektihakemusten käsittelyä koskevia ministerineuvoston hallinnollisia ohjeita. Samoin tulee noudattaa toteutettujen hankkeiden tilinpäätöstä ja tulosten raportointia koskevia ministerineuvoston hallinnollisia ohjeita.
Pohjoismainen yhteistyökomitea (NSK) on asettanut arktisen asiantuntijakomitean (ASK), jonka tehtävänä on avustaa arktiseen yhteistyöhön liittyvissä kysymyksissä. Asiantuntijakomitea koostuu vastaisuudessakin pohjoismaisista arktisen alueen ylemmistä virkamiehistä (Senior Arctic Officials) sekä Färsaarten ja Grönlannin edustajista. Asiantuntijakomitea toimii neuvonantajana ministerineuvoston arktisen toiminnan suunnittelussa, toteutuksessa ja seurannassa. Asiantuntijakomitea voi kutsua Inuittien sirkumpolaarisen konferenssin (ICC) Grönlannista ja Saamelaisneuvoston mukaan työhön niiden suuntaviivojen mukaisesti, jotka koskevat ministerineuvoston yhteistyötä vapaaehtoisjärjestöjen kanssa. Pohjoismainen yhteistyökomitea (NSK) ja yhteistyöministerit (MR-SAM) toimivat päätöksentekoeliminä arktisen yhteistyöohjelman piiriin kuuluvissa asioissa.
Ministerineuvoston sihteeristö huolehtii arktisen asiantuntijakomitean sihteeristötehtävistä. Projekti- ja budjettihallinnosta, projektiraportoinnista ja arktisen tietokannan päivityksestä vastaa puolestaan tarkoituksenmukainen hallinnointielin.