Både Nordisk råd og Nordisk ministerråd har flere samarbeidspartnere og deltar aktivt i andre regionale samarbeider.

Nordisk råd er med i det parlamentariske Østersjøsamarbeidet i BSPC, både gjennom å ha en delegasjon ved det årlige møtet, og gjennom å representere sine medlemsland i organisasjonens permanente komité. I den permanente arktiske parlamentarikerkomiteen (SCPAR), som er den parlamentariske motparten til Arktisk råd, har Nordisk råd observatørstatus.

Nordisk ministerråd har observatørstatus i Arktis råd, som er et samarbeidsorgan for regjeringer med arktiske områder innenfor sine territorier. I tillegg til de nordiske landene med Grønland og Færøyene, handler det om Canada, Russland og USA. Ministerrådet er også en aktiv deltaker i Baltic Sea Initiative, som arbeider for å styrke regionens konkurransekraft og i gjennomføringen på flere områder av EUs nordlige dimensjon. Dessuten deltar Ministerrådet som partner i samarbeid som er initiert av Barentsrådet og Barents regionråd.

Nordisk ministerråd har samarbeidskontorer i Estland, Latvia, Litauen, i Nordvestre Russland og i Kaliningrad.

Innenfor rammen for det offisielle samarbeidet finnes det mange nordiskeide institusjoner. I én av institusjonene – Den nordiske investeringsbanken (NIB) er også Estland, Latvia og Litauen medeiere (siden 2005).