Ett av kontorets viktigaste arbete är att urskilja nya trender och se nya möjligheter för gemensamt nordiskt estniskt samarbete i dialog med de nordiska representationerna, som kontoret har ett nära samarbete med. Kontoret arbetar också brett för att vara företrädare för det som är ”Nordiskt” och exponera det nordiska samarbetet i Estland.
Dessutom fungerar kontoret som projektadministrator för flera nordisk baltiska program och har ansvar för praktisk handläggning, kvalitetssäkring och liknande.
Härunder kan nämnas det nordisk-baltiska mobilitetsprogrammet för offentlig förvaltning som ger ekonomiskt stöd till statstjänstemän och annan personal inom den offentliga sektorn för att genomföra studiebesök och göra praktik samt för fortbildning och nätverksaktiviteter. Programmet har som mål att underlätta en harmonisering av mer effektiva arbetsmetoder för den offentliga sektorn.
Programmet pågår mellan 2009 och 2013 och administreras av Nordiska ministerrådets kontor i Estland.
Imants Gross, arbetar som tillförordnad direktör för kontoret i Tallinn fram tills att en ny person tillträder tjänsten. Imants Gross är också direktör för kontoret i Riga, som är hans ordinarie tjänst.