Det politiska samarbetet i sakfrågor sker i huvudsak Nordiska rådets fem fackutskott och i dess ledningsorgan - presidiet.
Alla politiska sakfrågor utom utrikes- och säkerhetspolitik, som är ledningens, presidiets ansvar, behandlas i något av de fem fackutskotten i Nordiska rådet.
Ett förslag som läggs av en medlem eller en grupp av medlemmar hänvisas till det relevanta utskottet för behandling. Utskottet kan till exempel välja att skicka förslaget för yttrande till olika instanser i de olika länderna, hålla en så kallad utfrågning med experter eller på annat sätt skaffa sej fakta till stöd för eller emot förslaget.
Utskottets förslag, i form av ett så kallat betänkande, går till Nordiska rådets ledningsorgan, presidiet eller till de två årliga möten; temasession och ordinarie session, för beslut om vad man skall rekommendera de nordiska regeringarna eller Nordiska ministerrådet att göra med anledning av förslaget.
Ett utskott kan också ägna sig åt att faktasökning för att avgöra om det finns anledning att ställa förslag om nordiska samarbetsåtgärder. Utskotten kan ha underutskott eller arbetsgrupper för avgränsade uppgifter under viss tid. Några av utskottets medlemmar kan då skaffa sig extra kunskap för att avgöra om utskottet skall gå vidare och försöka utforma förslag på området. Underutskottet eller arbetsgruppen kan också ha i uppdrag att komma med konkreta förslag till utskottet. Seminarier och konferenser anordnas ibland av utskotten för att väcka opinion eller delta i debatten om någon nordisk problemställning.
Nordiska rådets utskott har 13-15 medlemmar inklusive ordförande och vice ordförande. Utskottsmöten är inte offentliga. Konferenser och seminarier är dock ofta öppna för andra än medlemmarna och speciellt inbjudna.
Nordiska rådets utskott samarbetar med de nationella parlamentens motsvarande utskott samt med motsvarande utskott i Baltiska församlingen , Estland, Lettlands och Litauens parlamentariska samarbetsorgan, och med andra relevanta internationella organisationer.
Nordiska rådet har också en kontrollkommitté som har till huvuduppgift att kontrollera hur verksamhet som finansieras med gemensamma nordiska medel sköts samt att fattade beslut genomförs. Det finns dessutom en valkommitté som förbereder de val som görs på Nordiska rådets sessioner.
Ordförande, vice ordföranden och medlemmar i utskotten, presidiet, i kontrollkommittén och medlemmar i valkommittén väljs på Nordiska rådets ordinarie session på hösten för det kommande kalenderåret.